01630nas a2200265 4500008004100000022001400041245010200055210006900157260001600226490000700242520083100249653002001080653001101100653002201111653001101133653001701144653001001161100001801171700002201189700001701211700002001228700001901248700002101267856007601288 2021 eng d a0147-957100aMolecular detection of microorganisms in lice collected from farm animals in Northeastern Algeria0 aMolecular detection of microorganisms in lice collected from far cFeb-01-20210 v743 a
Lice (Phthiraptera) are highly specific insects organized into four suborders (Anoplura, amblycera, ischnocera and rhynchophthirina). Lice may affect human and animal health. Our objective was to study the bacterial community of lice collected in Algeria. Using molecular tools, we were able to identify by real time PCR the presence of Coxiella burnetii DNA in 1% (3/300) Linognathus africanus and in 0.3% (1/300) Linognathus vituli collected from goats and cattle respectively. We also detected the presence of Anaplasmataceae bacteria in Bovicola bovis, L. vituli from cattle and in L. africanus from goats. By standard PCR’s and sequencing, we were able to identify Anaplasma ovis in L. africanus as well as a novel Anaplasmataceae sp genotype corresponding probably to a new genus within this family.
10aAnaplasmataceae10acattle10aCoxiella burnetii10aGoats.10aPhthiraptera10asheep1 aOuarti, Basma1 aMediannikov, Oleg1 aRighi, Souad1 aBenakhla, Ahmed1 aRaoult, Didier1 aParola, Phillipe uhttps://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S014795712030158204520nas a2200289 4500008004100000022002500041245006400066210006300130260001600193300001400209490000700223520366800230653001903898653000903917653001703926653001903943100002103962700001803983700002304001700002704024700002804051700002204079700002004101700002104121700002004142856006804162 2020 eng d a0022-2585, 1938-292800aIdentification of Lice Stored in Alcohol Using MALDI-TOF MS0 aIdentification of Lice Stored in Alcohol Using MALDITOF MS cDec-21-2020 a1126-11330 v583 aRésumé
Les poux posent des problèmes majeurs de santé publique et vétérinaire, avec des conséquences économiques. Leur identification est essentielle et nécessite le développement d’une stratégie innovante. Le MALDI-TOF MS a récemment été proposé comme un outil rapide, peu coûteux et précis pour l’identification des arthropodes. L’alcool est l’une des méthodes de stockage les plus fréquemment utilisées et permet de conserver les échantillons pendant de longues périodes à température ambiante. Plusieurs études récentes ont rapporté que l’alcool modifie les profils protéiques résultant de l’analyse de la SEP. Après des études préliminaires sur les poux congelés, le but de cette recherche était d’évaluer l’influence de la conservation de l’alcool sur la précision de l’identification des poux par la SEP MALDI-TOF. À cette fin, des poux conservés dans l’alcool pendant des périodes variables ont été soumis à l’analyse de la SEP et les protocoles de préparation des échantillons ont été optimisés. La reproductibilité et la spécificité des spectres de MS obtenus sur ces arthropodes nous ont permis de mettre en œuvre la base de données des spectres de MS de référence (DB) avec les profils protéiques de sept espèces de poux stockés dans l’alcool. Des tests en aveugle ont révélé une identification correcte de 93,9% de Pediculus humanus corporis (Linnaeus, 1758) et de 98,4% des autres espèces de poux collectées sur le terrain. Cette étude a démontré que le MALDI-TOF MS pouvait être utilisé avec succès pour l’identification des poux stockés dans l’alcool pendant différentes durées.
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10aidentification10alice10aMALDI-TOF MS10astorage method1 aBenyahia, Hanene1 aOuarti, Basma1 aDiarra, Adama, Zan1 aBoucheikhchoukh, Mehdi1 aMeguini, Mohamed, Nadir1 aBehidji, Makhlouf1 aBenakhla, Ahmed1 aParola, Phillipe1 aAlmeras, Lionel uhttps://academic.oup.com/jme/article-abstract/58/3/1126/604259904368nas a2200241 4500008004100000245010500041210006900146260001200215300001000227490000700237520363500244653000903879653001703888653001503905100001803920700002103938700001703959700002803976700002004004700001904024700002104043856006204064 2020 eng d00aDevelopment of MALDI-TOF mass spectrometry for the identification of lice isolated from farm animals0 aDevelopment of MALDITOF mass spectrometry for the identification c04-2020 a14 pp0 v273 aMatrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is now routinely used for the rapid identification of microorganisms isolated from clinical samples and has been recently successfully applied to the identification of arthropods. In the present study, this proteomics tool was used to identify lice collected from livestock and poultry in Algeria. The MALDI-TOF MS spectra of 408 adult specimens were measured for 14 species, including Bovicola bovis, B. ovis, B. caprae, Haematopinus eurysternus, Linognathus africanus, L. vituli, Solenopotes capillatus, Menacanthus stramineus, Menopon gallinae, Chelopistes meleagridis, Goniocotes gallinae, Goniodes gigas, Lipeurus caponis and laboratory reared Pediculus humanus corporis. Good quality spectra were obtained for 305 samples. Spectral analysis revealed intra-species reproducibility and inter-species specificity that were consistent with the morphological classification. A blind test of 248 specimens was performed against the in-lab database upgraded with new spectra and validated using molecular tools. With identification percentages ranging from 76% to 100% alongside high identification scores (mean = 2.115), this study proposes MALDI-TOF MS as an effective tool for discriminating lice species.
French title: Développement de la spectrométrie de masse MALDI-TOF MS pour l’identification de poux isolés d’animaux de ferme
Résumé
La Spectrométrie de Masse à Temps de Vol par Désorption/Ionisation Laser Assistée après Matrice est maintenant utilisée pour l’identification rapide des microorganismes isolés à partir d’échantillons cliniques et a récemment été appliquée avec succès pour l’identification des arthropodes. Dans cette étude, cet outil protéomique a été utilisé pour identifier les poux prélevés sur le bétail et la volaille en Algérie. Les spectres MALDI-TOF MS de 408 spécimens adultes ont été mesurés pour 14 espèces, dont Bovicola bovis, B. ovis, B. caprae, Haematopinus eurysternus, Linognathus africanus, L. vituli, Solenopotes capillatus, Menacanthus stramineus, Menopon gallinae, Chelopistes meleagridis, Goniocotes gallinae, Goniodes gigas, Lipeurus caponis et Pediculus humanus corporis élevé en laboratoire. Des spectres de bonne qualité ont été obtenus pour 305 échantillons. L’analyse spectrale a révélé une reproductibilité intra-espèce et une spécificité inter-espèces qui concordaient avec la classification morphologique. Un test à l’aveugle de 248 échantillons a été effectué par rapport à la base de données de notre laboratoire mise à niveau avec de nouveaux spectres et validée à l’aide d’outils moléculaires. Avec des pourcentages d’identification allant de 76 à 100 % et des scores d’identification élevés (moyenne : 2,115), cette étude propose MALDI-TOF MS comme un outil efficace pour distinguer les espèces de poux.
10alice10aMALDI-TOF MS10aMallophaga1 aOuarti, Basma1 aLaroche, Maureen1 aRighi, Souad1 aMeguini, Mohamed, Nadir1 aBenakhla, Ahmed1 aRaoult, Didier1 aParola, Phillipe uhttps://www.parasite-journal.org/10.1051/parasite/2020026