04368nas a2200241 4500008004100000245010500041210006900146260001200215300001000227490000700237520363500244653000903879653001703888653001503905100001803920700002103938700001703959700002803976700002004004700001904024700002104043856006204064 2020 eng d00aDevelopment of MALDI-TOF mass spectrometry for the identification of lice isolated from farm animals0 aDevelopment of MALDITOF mass spectrometry for the identification c04-2020 a14 pp0 v273 a
Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is now routinely used for the rapid identification of microorganisms isolated from clinical samples and has been recently successfully applied to the identification of arthropods. In the present study, this proteomics tool was used to identify lice collected from livestock and poultry in Algeria. The MALDI-TOF MS spectra of 408 adult specimens were measured for 14 species, including Bovicola bovis, B. ovis, B. caprae, Haematopinus eurysternus, Linognathus africanus, L. vituli, Solenopotes capillatus, Menacanthus stramineus, Menopon gallinae, Chelopistes meleagridis, Goniocotes gallinae, Goniodes gigas, Lipeurus caponis and laboratory reared Pediculus humanus corporis. Good quality spectra were obtained for 305 samples. Spectral analysis revealed intra-species reproducibility and inter-species specificity that were consistent with the morphological classification. A blind test of 248 specimens was performed against the in-lab database upgraded with new spectra and validated using molecular tools. With identification percentages ranging from 76% to 100% alongside high identification scores (mean = 2.115), this study proposes MALDI-TOF MS as an effective tool for discriminating lice species.
French title: Développement de la spectrométrie de masse MALDI-TOF MS pour l’identification de poux isolés d’animaux de ferme
Résumé
La Spectrométrie de Masse à Temps de Vol par Désorption/Ionisation Laser Assistée après Matrice est maintenant utilisée pour l’identification rapide des microorganismes isolés à partir d’échantillons cliniques et a récemment été appliquée avec succès pour l’identification des arthropodes. Dans cette étude, cet outil protéomique a été utilisé pour identifier les poux prélevés sur le bétail et la volaille en Algérie. Les spectres MALDI-TOF MS de 408 spécimens adultes ont été mesurés pour 14 espèces, dont Bovicola bovis, B. ovis, B. caprae, Haematopinus eurysternus, Linognathus africanus, L. vituli, Solenopotes capillatus, Menacanthus stramineus, Menopon gallinae, Chelopistes meleagridis, Goniocotes gallinae, Goniodes gigas, Lipeurus caponis et Pediculus humanus corporis élevé en laboratoire. Des spectres de bonne qualité ont été obtenus pour 305 échantillons. L’analyse spectrale a révélé une reproductibilité intra-espèce et une spécificité inter-espèces qui concordaient avec la classification morphologique. Un test à l’aveugle de 248 échantillons a été effectué par rapport à la base de données de notre laboratoire mise à niveau avec de nouveaux spectres et validée à l’aide d’outils moléculaires. Avec des pourcentages d’identification allant de 76 à 100 % et des scores d’identification élevés (moyenne : 2,115), cette étude propose MALDI-TOF MS comme un outil efficace pour distinguer les espèces de poux.
10alice10aMALDI-TOF MS10aMallophaga1 aOuarti, Basma1 aLaroche, Maureen1 aRighi, Souad1 aMeguini, Mohamed, Nadir1 aBenakhla, Ahmed1 aRaoult, Didier1 aParola, Phillipe uhttps://www.parasite-journal.org/10.1051/parasite/202002601406nas a2200205 4500008004100000245013800041210006900179520073300248653001300981653000900994653001501003653000901018653001601027100002001043700002001063700002001083700001901103700002001122856005801142 2014 eng d00aPrevalence and seasonal variation of mallophagan species (Phthiraptera) in free-range chickens from rural localities of oran, Algeria0 aPrevalence and seasonal variation of mallophagan species Phthira3 a
A total of 192 free-range chickens was randomly collected from rural localities in the region of Oran (Algeria) and examined to detect the presence of Mallophagan species and their prevalence, mean intensity and seasonal variation. Eight species were recorded, Chelopistes meleagridis, Cuclotogaster heterographus, Goniocotes gallinae, Goniodes dissimilis, Goniodes gigas, Lipeurus caponis, Menacanthus cornutus and Menopon gallinae. Goniocotes gallinae was the most prevalent lice identified (95,31%). The infection rate was higher in males compared to female chickens with a significant difference (P<0,05). The total number of Mallophagan species encountered was higher in winter season than in the other seasons.
10achickens10alice10aMallophaga10aOran10aTraditional1 aMedjouel, Ilyes1 aBenakhla, Ahmed1 aSenouci, Kheira1 aDjelil, Hanene1 aMatallah, Fouzi uhttp://sjournals.com/index.php/SJAs/article/view/1205